المستوى المحلي 

(1) مؤسسة الكويت للتقدم العلمي: بالكويت والتعاون وثيق بين المنظمة  والمؤسسة منذ قيام فكرة إنشاء المنظمة حيث دعمت المؤسسة عددا، من الأبحاث العلمية المتعلقة بمجال الطب الإسلامي وما زالت تقدم هذه المنح سنويا .
أيضا خصصت عددا من الجوائز السنوية وفاز بها عدد من العلماء المهتمين بهذا المجال.
وساهمت في بعض مطبوعات المنظمة الإسلامية للعلوم الطبية.

(2) المجلس الوطني للثقافة والفنون والآداب( قسم التراث): بالكويت
عقد أول مؤتمر في مجال الطب الإسلامي بالتعاون مع المجلس وأيضا الـتعاون وثيق بين 

قسم التراث والمنظمة حيث قام قسم التراث بتزويد مكتبة المنظمة بالعديد من صور المخطوطات المتوافرة لديه وأخيرا تم القيام بتصوير عدد من المخطوطات في مجال الطب الإسلامي من البحرين بالتعاون مع قسم 
ا لتراث.

(3) الموسوعة الفقهية. بالكويت
تشارك الموسوعة الفقهية بعلمائها في جميع مؤتمرات المنظمة الاسلامية للعلوم الطبية وكذلك ندواتها الفقهية. وتوفري المراجع اللازمة لذلك مما انعكس على الفتاوى التي تصدر من الموسوعة والتي تأتي مطابقة لما تم بحثه في ندوات المنظمة الإسلامية للعلوم الطبية . 

(4) جامعة الكويت:
والتعاون وثيق بينهما في المجالات التي تهم كلا من المنظمة وكليات الجامعة المهتمة بموضوع الطب ا لإسلامي.

هذا وقد استطاع المركز أن ينجز  الآتي:

أولا: أن يحقق ثلاث من أمهات الكتب في التراث الطبي الإسلامي وهي الحاوي لأبي بكر الرازي والقانون لابن سينا وجامع المفردات لابن البيطار حيث تم وضع المسمى العلمي للنباتات التي تم ذكرها في هذه الكتب واسم العائلة التي تنتمي إليها هذه النباتات وكذلك الاسم باللغة العربية والإنجليزية والهندية والفارسية إن وجد، أيضا تم وضع استعمالاتها حسبما ذكرت في كتاب القانون لابن سينا.

ثانيا: تم وضع مواصفات لحوالي 250 نباتا من الناحية الظاهرية والتشريحية والفحص المجهري لمسحوق النبات ووضع الثوابت الكيميائية لهذه النباتات وكذلك نسبة المواد الفعالة (إن وجد). وذلك باستخدام أحدث الأجهزة المتخصصة في هذا المجال.

ثالثآ: يقوم المركز بإنتاج حوالي ثلاثين مستحضرا صيدليا في شكلها النهائي مع وضع المواصفات الخاصة به سواء من النواحي الطبيعية أو الكيميائية أو الأقر باذينية. 

رابعا: استطاع المركز أن يجري أبحاثا على المستحضرات الصيدلية والتي ينتجها لوضع الشروح العلمية لطريقة تأثير هذه المستحضرات بالمقارنة بالمواد الكيميائية المعروفة.